Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cnot8Q9D8X5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot8Q9D8X5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot8Q9D8X5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms