Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fam3aQ9D8T0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam3aQ9D8T0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms