Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo2Q9D8S4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo2Q9D8S4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms