Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c6Q9D8P7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c6Q9D8P7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms