Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms