Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vstm5Q9D806 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vstm5Q9D806 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms