Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chmp5Q9D7S9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp5Q9D7S9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp5Q9D7S9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms