Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2dQ9D7M8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2dQ9D7M8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms