Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmigd1Q9D7L8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmigd1Q9D7L8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmigd1Q9D7L8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms