Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chmp4cQ9D7F7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp4cQ9D7F7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp4cQ9D7F7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4cQ9D7F7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms