Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop56Q9D6Z1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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