Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb4aQ9D6F9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms