Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc9bQ9D6E4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms