Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip1Q9D620 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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