Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zcchc13Q9D548 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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