Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhox2aQ9D4Y3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rhox2aQ9D4Y3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms