Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2al3Q9D4U4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms