Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931428L18RikQ9D4S9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms