Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lonrf3Q9D4H7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms