Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gcc1Q9D4H2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gcc1Q9D4H2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gcc1Q9D4H2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gcc1Q9D4H2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms