Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc6Q9D4E6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc6Q9D4E6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pabpc6Q9D4E6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pabpc6Q9D4E6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms