Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D5

4933414I15Rik, RIKEN cDNA 4933414I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933414I15RikQ9D4D5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4933414I15RikQ9D4D5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933414I15RikQ9D4D5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms