Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syce1Q9D495 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syce1Q9D495 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms