Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933428M09RikQ9D3X3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms