Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd2Q9D3B1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd2Q9D3B1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hacd2Q9D3B1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms