Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urm1Q9D2P4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urm1Q9D2P4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urm1Q9D2P4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urm1Q9D2P4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urm1Q9D2P4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urm1Q9D2P4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urm1Q9D2P4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urm1Q9D2P4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urm1Q9D2P4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urm1Q9D2P4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urm1Q9D2P4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urm1Q9D2P4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Urm1Q9D2P4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms