Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps33aQ9D2N9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps33aQ9D2N9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps33aQ9D2N9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps33aQ9D2N9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps33aQ9D2N9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps33aQ9D2N9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps33aQ9D2N9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps33aQ9D2N9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps33aQ9D2N9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps33aQ9D2N9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps33aQ9D2N9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps33aQ9D2N9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps33aQ9D2N9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps33aQ9D2N9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps33aQ9D2N9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms