Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Z3

Fam173b, Protein FAM173B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam173bQ9D1Z3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Fam173bQ9D1Z3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam173bQ9D1Z3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms