Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal2bQ9D1Y9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal2bQ9D1Y9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal2bQ9D1Y9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal2bQ9D1Y9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2bQ9D1Y9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms