Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G2

Pmvk, Phosphomevalonate kinase, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmvkQ9D1G2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmvkQ9D1G2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmvkQ9D1G2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmvkQ9D1G2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmvkQ9D1G2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PmvkQ9D1G2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PmvkQ9D1G2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms