Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl28Q9D1B9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl28Q9D1B9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms