Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mms19Q9D071 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mms19Q9D071 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms