Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssbp3Q9D032 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssbp3Q9D032 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp3Q9D032 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms