Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3bQ9CZT8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms