Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZS1

Aldh1b1, Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1b1Q9CZS1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1b1Q9CZS1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1b1Q9CZS1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1b1Q9CZS1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1b1Q9CZS1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1b1Q9CZS1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1b1Q9CZS1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1b1Q9CZS1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1b1Q9CZS1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1b1Q9CZS1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1b1Q9CZS1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1b1Q9CZS1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1b1Q9CZS1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Aldh1b1Q9CZS1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Aldh1b1Q9CZS1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Aldh1b1Q9CZS1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms