Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdhd3Q9CYW4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms