Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins3Q9CY94 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins3Q9CY94 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms