Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PmpcbQ9CXT8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PmpcbQ9CXT8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms