Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nip7Q9CXK8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Nip7Q9CXK8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms