Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xrcc3Q9CXE6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc3Q9CXE6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms