Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm8aQ9CWZ3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms