Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpusd4Q9CWX4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd4Q9CWX4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpusd4Q9CWX4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms