Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pin4Q9CWW6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pin4Q9CWW6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pin4Q9CWW6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms