Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tubb2bQ9CWF2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb2bQ9CWF2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb2bQ9CWF2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms