Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atxn3Q9CVD2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atxn3Q9CVD2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atxn3Q9CVD2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms