Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930524J08RikQ9CUJ5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930524J08RikQ9CUJ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930524J08RikQ9CUJ5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930524J08RikQ9CUJ5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930524J08RikQ9CUJ5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930524J08RikQ9CUJ5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930524J08RikQ9CUJ5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930524J08RikQ9CUJ5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930524J08RikQ9CUJ5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms