Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp13a2Q9CTG6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp13a2Q9CTG6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a2Q9CTG6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a2Q9CTG6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a2Q9CTG6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a2Q9CTG6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a2Q9CTG6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a2Q9CTG6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms