Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029F12RikQ9CRB4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms