Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msmo1Q9CRA4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msmo1Q9CRA4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms