Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkiras2Q9CR56 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkiras2Q9CR56 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkiras2Q9CR56 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkiras2Q9CR56 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms